5'-3'外切核酸酶活性是指DNA聚合酶能夠從DNA鏈的5'端向3'端切除核苷酸的能力。這種活性通常用于修復受損的DNA或去除錯誤配對的核苷酸。具體來說,5'-3'外切核酸酶活性可以在DNA合成過程中切除前方的核苷酸,幫助錯誤或不需要的序列,從而確保DNA的正確復制和修復。在DNA聚合酶中,5'-3'外切核酸酶活性與聚合酶活性相輔相成。聚合酶在合成新鏈時,5'-3'外切酶活性可以在發現錯誤時進行修正,確保合成的DNA鏈的準確性。例如,E.coliDNA聚合酶I具有這種外切酶活性,可以在合成過程中去除錯誤的核苷酸,從而提高DNA的保真度。需要注意的是,BstDNAPolymerase,LargeFragment不具有5'-3'外切核酸酶活性,這使得它在某些應用中更為穩定,特別是在等溫擴增反應中,如LAMP(環介導等溫擴增)和RCA(滾環擴增)等。許多Probe qPCR Mix (2×)產品采用熱啟動DNA聚合酶,能減少非特異性擴增,提高反應的靈敏度和特異性 。Recombinant Mouse DR6/TNFRSF21 Protein,His Tag
使用BloodGenomicDNAIsolationKitwithMagneticBeads(血液基因組DNA提取試劑盒,磁珠法)進行血液樣本中基因組DNA的提取,主要步驟如下:1.**實驗準備**:準備抗凝全血樣本(如EDTA抗凝血),移液器及無菌,15ml離心管,無水乙醇,70%乙醇,干凈的吸水紙,渦旋振蕩器,金屬浴/水浴,臺式離心機等。2.**樣本處理**:取適量血液樣本,根據試劑盒要求,可能需要將血液體積調整至特定量,例如200μl,并可能需要加入PBS緩沖液。3.**裂解血液細胞**:向血液樣本中加入蛋白酶K和細胞裂解液,渦旋混勻后,置于金屬浴或水浴中進行裂解,通常在65°C孵育10-15分鐘,并在此期間定期混勻。4.**DNA與磁珠結合**:向裂解后的樣本中加入異丙醇和磁珠懸浮液,渦旋混勻后,室溫放置一段時間,以便于基因組DNA與磁珠結合。5.**磁珠分離**:將樣本置于磁力架上,待磁珠聚集后,小心移除上清液,去除雜質。6.**洗滌磁珠**:向磁珠中加入漂洗液和洗滌液,進行洗滌以去除殘留的蛋白質和鹽分,然后再次使用磁力架分離磁珠,移除洗滌液。
在DNA提取過程中避免RNA污染的關鍵在于采取一系列措施來確保RNA被有效去除或降解,同時保護DNA的完整性和純度。以下是一些確保DNA提取過程中避免RNA污染的策略:1.**使用專門的DNA提取試劑盒**:選擇高質量的DNA提取試劑盒,這些試劑盒通常已經包含了防止RNA污染的措施,如特定的裂解液和純化步驟,能夠有效去除RNA。2.**加入RNA酶(RNase)處理**:在DNA提取過程中加入RNase處理步驟,可以有效地去除殘留的RNA污染。RNase是一種能夠特異性降解RNA的酶,可以在不影響DNA完整性的前提下去除RNA污染。3.**優化實驗操作步驟**:在破碎細胞時,選擇合適的破碎方法和破碎時間,避免過度破碎導致RNA的釋放;在DNA純化階段,控制好離心速度和時間,避免RNA的沉淀。4.**使用無RNase的試劑和耗材**:使用經過RNase-free處理的實驗器材和試劑,確保實驗過程中不會引入外源性RNA污染。5.**嚴格控制實驗環境**:保持實驗室臺面和工作區域干凈無塵,定期對實驗室進行消殺,避免RNA酶污染。6.**個人防護和操作規范**:在處理DNA樣品時,佩戴無菌手套和口罩,以減少呼吸道和皮膚污染的風險。使用不同的工具處理不同的樣品,或者在處理前后徹底清洗工具,避免交叉污染。
核酸內切酶VIII(EndonucleaseVIII)是一種來自大腸桿菌的DNA損傷修復酶,具有以下特點:1.**雙功能活性**:核酸內切酶VIII具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。2.**釋放受損嘧啶堿基**:N-糖基化酶活性可以釋放雙鏈DNA上受損的嘧啶堿基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,生成一個脫嘌呤(apurinic,AP)位點。3.**切割AP位點**:AP裂解酶活性可以切割AP位點的3'和5'端,產生一個具有3'和5'磷酸的堿基缺口(Gap)。4.**識別并切除受損堿基**:核酸內切酶VIII可以識別并切除多種受損堿基,包括尿素、5,6-二羥基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲內酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5,6-二氫胸腺嘧啶和甲基羥丙二酰脲。5.**與EndonucleaseIII的區別**:雖然核酸內切酶VIII與核酸內切酶III相似,但核酸內切酶VIII具有β和δ裂解酶活性,而核酸內切酶III具有β裂解酶活性。6.**應用領域**:核酸內切酶VIII可以應用于單細胞凝膠電泳、NGS建庫中DNA損傷修復、酶法合成DNA中釋放DNA鏈、堿洗脫,搭配尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)進行含U片段的克隆等。
在質粒DNA提取過程中,確保DNA的完整性和活性至關重要,這通常涉及以下幾個關鍵因素:1.**溫和的裂解條件**:選擇適當的裂解方法對于保持DNA的完整性至關重要。對于大于15kb的質粒DNA,應采用溫和的裂解方法,如將細菌懸浮于等滲的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破壞細胞壁和細胞膜,以減少對質粒DNA的機械剪切力,從而保護其完整性。2.**避免過度裂解**:在質粒提取過程中,并非裂解時間越長越好。過長的裂解時間可能會造成基因組DNA片段的污染,影響質粒的純度。3.**適當的洗滌和洗脫**:在純化過程中,適當的洗滌可以去除蛋白質和其他雜質,但過度洗滌可能會導致DNA的損失。洗脫步驟中,確保洗脫液完全浸潤柱膜,以保證結合在柱膜上的質粒得以充分洗脫,避免因洗脫體積過小而影響質粒得率。4.**避免DNA的降解**:在提取過程中,添加核酸酶抑制劑可以防止DNA被核酸酶降解。同時,避免長時間將DNA暴露在室溫下,以及避免多次凍融循環,這些都有助于保護DNA的完整性。5.**低溫操作**:盡量在低溫條件下進行提取操作,以減少核酸酶的活性,從而保護DNA的完整性。
Ultra-Long Master Mix 在分子生物學實驗中的應用主要集中在需要擴增長片段DNA序列的場合。Recombinant Mouse DR6/TNFRSF21 Protein,His Tag
確保Cre重組酶只作用于特定細胞,主要通過以下幾種方式實現:1.**組織特異性啟動子**:-利用組織特異性啟動子控制Cre重組酶的表達,可以確保Cre酶只在特定組織或細胞中表達。這種方法通過將Cre基因置于特定細胞類型特有的啟動子控制之下,實現對Cre酶表達的精確控制。2.**誘導型Cre重組酶系統**:-通過使用Cre-ERT(雌素受體突變體與Cre重組酶的融合蛋白),可以實現對Cre活性的時間控制。在無他莫昔芬誘導時,Cre-ERT與熱激蛋白Hsp90結合,定位于細胞質中;當他莫昔芬給藥誘導時,Hsp90脫離Cre-ERT,使Cre-ERT進入細胞核發揮基因重組的作用。這種系統相當于為Cre-Lox系統加裝了一個由他莫昔芬控制的外源開關,使得體內基因編輯更具時空靈活性。3.**藥物誘導的Cre系統**:-例如Tet-on系統,通過四環素或其衍生物多西環素的添加來激起基因表達。在三重轉基因動物中,rtTA在特定啟動子的控制下表達,多西環素與rtTA結合,Cre的表達,導致固定的報告基因重組。4.**AAV遞送Cre**:-利用包含組織特異性啟動子的腺相關病毒(AAV)載體可以選擇性地將Cre重組酶遞送至特定細胞。
Recombinant Mouse DR6/TNFRSF21 Protein,His Tag
重組人TNFSF12蛋白(hFcTag)是一種在哺乳動物細胞中表達的重組蛋白,融合了hFc標簽,便于純化和檢測。TNFSF12(TumorNecrosisFactorSuperfamilyMember12),也稱為TWEAK(TNF-likeweakinducerofapoptosis),是TNF超家族的重要成員,廣參與免疫調節、細胞存活、炎癥反應和組織修復。它在多種生物學過程中發揮關鍵作用,尤其是在免疫細胞的啟動和組織損傷后的修復過程中。TNFSF12的功能與機制TNFSF12通過其胞外區與受體TNFRSF12A(也稱為TWEAKR或Fn14)結合,啟動下游的信號通路。TNFSF12的信號轉...