常用總RNA提取試劑:異硫氰酸胍法和Trizol法是動物組織及動物細胞總RNA提取較常用的方法,異硫氰酸胍法操作簡單快捷,適用于樣本足夠大的常規動物組織;Trizol法裂解能力較強,尤其適合小樣本及特別難提取的組織,如兔子皮膚,動物結締組織等總RNA的提取;另外Trizol作為一種通用型的裂解試劑,還可以用于植物組織、細菌、菌類等組織的提取。對于含多糖多酚的植物組織如油茶、茶葉、油菜等還可以使用CTAB法進行總RNA的提取。提取RNA時我們經常遇到的問題是:(1)RNA產量較低;(2)RNA有嚴重的鹽類污染;(3)RNA有嚴重的有機溶劑污染;(4)樣品降解等問題。普通的提取實驗用國產的試劑盒就足以,價格不高,基本上各地均有現貨。溫州正規RNA提取試劑廠家推薦
昆蟲RNA柱式提取試劑盒使用方法:RNA完整性的電泳檢測:如果需要做Northern雜交,強烈建議用戶使用甲醛變性膠進行RNA電泳,因為非變性膠不能分離所有的RNA分子。注意:大部分昆蟲的28SRNA被切割成兩個小的片段,彼此用氫鍵相連,所以在甲醛變性膠中,沒有28S帶出現。RNA產量產率測定:將5~10μLRNA溶于TE緩沖液中(pH7.5~8.2之間)檢測其在OD260的光吸收。通過光吸收可以得出RNA濃度(1OD260的RNA=40μg/mL),進而計算出RNA的產量(濃度X體積)和產率(RNA產量/組織用量)。RNA純度測定:無污染的總RNA的OD260/OD280一般在1.8~2.1之間(具體數值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關),高于此范圍則分別表示樣品可能有蛋白質污染,但一般不影響RT-PCR等反應。溫州正規RNA提取試劑廠家推薦RNA提取試劑:能夠作RNA印跡分析、斑點雜交、poly(A)+選擇。
RNA提取試劑的選擇:對于富含多糖多酚的植物類組織提取是個難點,Takara精心研發的柱型提取試劑TaKaRaMiniBESTPlantRNAExtractionKit可以輕松解決這個問題。TaKaRaMiniBESTPlantRNAExtractionKit可以高效地從各種簡單的植物組織材料(葉片、莖、幼苗等)、富含多糖多酚的植物組織材料(果實、種子等)、菌類提取高純度的TotalRNA,適用范圍普遍。按照標準流程,本試劑盒可以有效地提取分子量大于200nt的RNA,也可以按照可選步驟提取得到包含SmallRNA(<200nt)的TotalRNA。試劑盒中包含了RNA提取所需的全部試劑,無需額外購買其它試劑。
piRNA。是一類長度約為24-31nt的非編碼小RNA,通過特異性地與PIWI蛋白結合而發揮生物學作用。現已發現其在生殖干細胞分化、胚胎發育、維持基因組完整性、表達遺傳學調控、異染色質的形成和物種的性別決定等方面起著重要作用,此外在壓制轉座子轉錄和基因轉錄后調控中也扮演著重要角色,并且越來越多的研究表明在病癥組織中piRNA的表達不盡相同。lncRNA。長度約為200-100000個核苷酸,可以通過不同的分子生物學機制調控編碼基因的表達,參與疾病相關的信號通路,對疾病的發生、發展及醫治有重要作用。研究發現,lncRNA-DANCR明顯增強肝病細胞的感性特征,促進一些疾病細胞的形成,在體內干擾DANCR的作用可導致一些疾病細胞活力降低,同時阻止一些miRNA的壓制效應,揭發出一個涉及lncRNA、mRNA和miRNA的新一些疾病形成機制。可見,lncRNA對一些疾病方面有重要作用。另外有研究發現lncRNA在宿主抗病菌反應、骨關節炎、囊性纖維化、藥物研發等方面也有重要的臨床應用價值。RNA存在于水相中。水相轉移后,RNA通過異丙醇沉淀回收。
經典Trizol法并不能獲得總RNA:這個事實可能會刷不少新手甚至老手的三觀,但確有實驗支持:經典Trizol法會選擇性丟失低GC比的miRNA。這一點,源自一則作者自撤稿的故事。V.NarryKim是韓國鼎鼎大名的美女科學家,專做RNA相關的研究,包括miRNA。幾年前她們組發現一個奇怪的“現象”,即貼壁細胞在消化之后,會有一些miRNA的豐度突然降低,看起來好像是被快速“降解”掉了,并據此寫了一篇文章發到MolecularCell上。但很快她們就發現,這個“現象”難以重復:如果用Trizol做實驗,就一定是陽性結果,而用試劑盒提RNA,就重復不出來。難道是號稱能提總RNA的Trizol方案出了問題?確實如此。經進一步實驗后發現,經典的Trizol方案會使得低GC比的miRNA丟失。拭子RNA提取試劑的選擇?對離心柱法而言,拭子核酸得率的高低。廈門正規RNA提取試劑銷售廠家
rRNA是組成核糖體的組分,是蛋白質合成的工作場所。溫州正規RNA提取試劑廠家推薦
RNA是核糖核酸,DNA是脫氧核酸。區別:紫外吸收:核酸的λm=260nm,堿基展開程度越大,紫外吸收就越厲害。當A=1時,DNA:50ug/ml,RNA和單鏈DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml。用A260/A280還可來表示核酸的純度。沉降速度:對于拓撲異構體(核苷酸數目相同的核酸),其沉降速度從達到小依次為:RNA;超螺旋DNA>解鏈環狀DNA;松弛環狀DNA;線形DNA也就是在離心管中較上層是線形DNA,較下面是RNA。電泳:核苷酸、核酸均可以進行電泳,泳動速度主要由分子大小來決定,因此,電泳是測定核酸分子量的好方法。DNA分子量測定較直接的方法:用適當濃度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以將其他形式的DNA變成線形DNA,用電鏡測出其長度,按B-DNA模型算出bp數,根據核苷酸的平均分子量就可計算出DNA的分子量。溫州正規RNA提取試劑廠家推薦
總RNA提取試劑試劑能促進不同種屬不同分子量大小的多種RNA的析出。例如,從大鼠肝臟抽提的RNA瓊脂糖凝膠電泳并用溴化乙啶染色,可見許多介于7kb和15kb之間不連續的高分子量條帶(mRNA和hnRNA成分),兩條優勢核糖體~5kb(28S)和~2kb(18S),低分子量RNA介于0.1和0.3kb之間(tRNA,5S)。當抽提的RNA用TE稀釋時其A260/A280比值≥1.8。注意如果是普通瓊脂糖凝膠電泳,28S的位置大約在2kb,18S大約在1kb的位置,不同濃度的凝膠位置變化較大。注意事項:樣品用總RNA提取試劑勻漿后,如果不即刻加入氯仿之前,置于-70°C下可放置一個月以上。保存在7...